I Holland sætter myndighederne ingen spørgsmålstegn ved Scientology kirkens religiøse status og natur. I årenes løb har både de nationale myndigheder og domstolene udstedt utallige anerkendelser af Scientology som religion samt bekræftet, at Scientology kirken er en religiøs organisation, der tilbyder religiøse tjenester til sine medlemmer. Scientology kirken er registreret som en religiøs organisation med status som juridisk person.
Ministerier i Holland udtrykker deres anerkendelse af Scientology religionen i deres behandling af kirken, dens medlemmer og præster. For eksempel har justitsministeriet bevilget Scientology præster ret til at besøge fængsler for at yde sjælesorg til fanger, undervisningsministeriet giver scientologer ret til at danne deres egne skoler for at uddanne deres børn i overensstemmelse med deres religiøse overbevisning, og skattemyndighederne anerkender Scientologys status som religion.
I 2007 søgte et Scientology medlem om og fik godkendelse fra domstolene til at give sit barn hjemmeundervisning baseret på hendes og hendes datter er religiøse overbevisning. Retten henviste til den Europæiske Menneskerettighedsdomstols kendelse i Scientology kirken mod Moskva (5. april 2007, ansøgningsnr. 18147/02). I overensstemmelse med principperne for religiøs ligestilling og ikke-diskrimination blev en ansat i skattevæsnet i 1991 pålagt af sine overordnede til at behandle en Scientology præsts selvangivelse på samme måde som de behandles for gejstlige fra andre religioner.
