I Kroatien defineres religiøse samfunds juridiske status generelt af deres lov om religiøse samfunds juridiske status fra 2002, og den omfatter sådanne emner som statsstøtte, skattefordele og religionsundervisning i skoler. Registrering af religiøse grupper er ikke obligatorisk. Registrerede grupper får dog status som juridisk person og opnår visse skattefordele og andre goder.
Scientology kirken i Kroatien blev officielt registreret som en religiøs organisation den 22. december 2003 i registeret over religiøse samfund i Republikken Kroatien. Justitsministeriet ikke bare anerkendte Scientology kirken i Kroatien, men anerkendte også religionen Scientology, så andre religiøse Scientology organisationer også vil kunne registreres fremover.

”Godkendt til at indføre SCIENTOLOGY KIRKEN I KROATIEN … i Registret over religiøse samfund i Kroatien.”