Religiøse grupper i Tyskland kan bedrive deres virksomhed i forskellige juridiske former, som er åbne for både religiøse og ikke-religiøse samfund. Disse rangerer fra almennyttige nonprofit organisationer til selskaber ifølge forvaltningsloven. Scientology kirker i Tyskland er juridisk registreret som almennyttige nonprofit foreninger og har klart erklærede religiøse mål. Som sådan er deres formelle juridiske status er ikke anderledes end mange andre anerkendte religiøse samfund såsom buddhister, muslimer, hinduer, kvækere, Jehovas Vidner og Bahá’íer.
I de sidste tre årtier har de tyske domstole – i omkring 50 domme – bestemt, at kirken og dens medlemmer beskyttes af religionsfriheden, der er garanteret ifølge den tyske forfatnings artikel 4.*
For eksempel:
- I sagen Hoppe mod Scientology Kirche Hamburg e.V. (dom af 5. januar 1998, sagsnr. 330 O 169/97) anerkendte Hamburgs højesteret, at kirken er ”anerkendt som et religiøst samfund” og beskyttes af forfatningens artikel 4.
- I sagen Krüger mod byen Hamburg, der handlede om byen Hamburgs brug af et ”sekt-filter”, hvorved forretningspartnere skulle erklære, at de ikke var medlemmer af Scientology, fastholdt både delstaten Hamburgs højeste forvaltningsdomstol (dom af 17. juni 2004, sagsnr. 1 Bf 198/00) og den føderale forvaltningsdomstol efter en ankesag om lovmæssige spørgsmål (endelig dom af 15. december 2005, sagsnr. 7 C 20.04), at ”sagsøgeren kan som udøvende Scientolog påberåbe sig beskyttelsen af den religiøse eller filosofiske trosretning i henhold til den tyske forfatnings artikel 4 stykke 1.” Baseret på denne kendelse forbød domstolene byen Hamburgs brug af et sektfilter.
Tyske domstole har gentagne gange anerkendt, at artikel 4 i den tyske forfatning vedrørende trosfrihed, tankefrihed og bekendelsesfrihed til en religion eller verdensanskuelse gælder for scientologer og Scientology kirken.
”Omfanget af Scientology organisationens idéer behandler transcendentalt indhold og menneskets position og betydning i verden. Hvis disse læresætninger fra L. Ron Hubbard vedrørende den udødelige sjæl som bærebølgen af en livsenergi (THETA) og betragter THETANEN, og angående dens forhold til det materielle univers betegnet som MEST, og om sti af sjælen gennem utallige livstider, bliver troet, og hvis vejen til højere niveauer af eksistens (clear og [opererende] thetan) det minder én om niveauer af frelse, er identificeret med, så dette kendetegner en filosofisk overbevisning eller en trosretning.”