Omtrent tredive religiøse organisationer er registreret med Taiwans indenrigsministeriums afdeling for religiøse anliggender. Religiøse organisationer kan indregistrere sig med de centrale myndigheder gennem deres filialer over hele øen i overensstemmelse med tempelforvaltningsloven, medborgerorganisationsloven eller kapitlet i civilloven som omhandler stiftelser og foreninger. Den 14. marts 2003 blev Scientology kirken tilføjet til Taiwans indenrigsministeriums liste over formelt anerkendte trossamfund.
”Så snart ansøgeren betragtes som en ny religion, skal den aflevere information om dens egne religiøse lære, formål, skrifter, ritualer og religiøse organisationsstruktur osv. til ministeriet til brug for reference. Derfor er jeres organisation blevet godkendt som opgraderet til et national religiøst selskab. Så det er nu en kendsgerning, at jeres selskab er anerkendt som en ny religion.”
